Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Fam220aQ3ZN08 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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