Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Znf48Q3US17 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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