Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm648Q3UJ22 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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