Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms