Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atp2b3Q0VF55 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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