Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms