Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MestQ07646 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MestQ07646 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms