Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top1Q04750 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms