Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms