Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms