Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SeleQ00690 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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