Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms