Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms