Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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