Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms