Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Irf5P56477 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Irf5P56477 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Irf5P56477 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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