Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms