Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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