Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl5P47962 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms