Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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