Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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