Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TP20293 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TP20293 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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