Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P20040 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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