Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms