Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18532 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18532 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms