Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P10404 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P10404 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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