Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Igsf6P0C6B7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms