Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb1P09055 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms