Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms