Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20795J3QP49 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms