Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms