Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms