Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms