Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms