Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc6D3YZP9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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