Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms