Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed5B2RPU8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed5B2RPU8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms