Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms