Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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