Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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