Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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