Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms