Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms