Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rnf6Q9DBU5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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