Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nop56Q9D6Z1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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