Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms