Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Mms19Q9D071 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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