Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gins3Q9CY94 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gins3Q9CY94 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gins3Q9CY94 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gins3Q9CY94 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gins3Q9CY94 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms