Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms