Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms